Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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