Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL54Q6P161 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms