Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H3F3CQ6NXT2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms