Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms