Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO47Q5MNV8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO47Q5MNV8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms