Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF542PQ5EBM4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms