Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms