Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms