Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms