Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTC1Q2NKJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms