Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RTL8BQ17RB0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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