Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN1Q16799 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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