Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LY6EQ16553 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms