Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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