Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CNGA3Q16281 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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