Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN9AQ15858 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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