Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms