Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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