Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIXQ14938 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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