Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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