Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCNIQ14094 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNIQ14094 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms