Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms