Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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