Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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