Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YOR283WYOR283W 693 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 snR43snR43 209 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 UBX3YDL091C 1368 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 BNI1YNL271C 5862 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 APM3YBR288C 1452 nt2.19□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 IRC8YJL051W 2469 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 GPI17YDR434W 1605 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 snR5snR5 204 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 COG2YGR120C 789 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 PDP3YLR455W 915 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 CRS5YOR031W 210 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 NEL1YHR035W 1893 nt2.18□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 NPR3YHL023C 3441 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YFH1YDL120W 525 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 ADK1YDR226W 669 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 RPS17BYDR447C 411 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YGR242WYGR242W 309 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 GIM3YNL153C 390 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YOR169CYOR169C 465 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YCL007CYCL007C 393 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 NCS2YNL119W 1482 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 TFC3YAL001C 3483 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YDR186CYDR186C 2634 nt2.17□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 AMS1YGL156W 3252 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 SSD1YDR293C 3753 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YDL163WYDL163W 303 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 TIF35YDR429C 825 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 FAR7YFR008W 666 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 AIM19YIL087C 474 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YNL150WYNL150W 408 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YNL235CYNL235C 432 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 MIX23YBL107C 591 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 ARL3YPL051W 597 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YJL181WYJL181W 1836 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 MCD1YDL003W 1701 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YIL166CYIL166C 1629 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 UBP16YPL072W 1500 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 STH1YIL126W 4080 nt2.16□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 SAP185YJL098W 3177 nt2.15□□□□□ -2.06
RPN6Q12377 YDL158CYDL158C 309 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YDR115WYDR115W 318 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SNO3YFL060C 669 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 MPO1YGL010W 525 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 CKA1YIL035C 1119 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 PET191YJR034W 327 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SRP21YKL122C 504 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 ECM9YKR004C 1134 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 RGM1YMR182C 636 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SNO2YNL334C 669 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YOL150CYOL150C 312 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 OST2YOR103C 393 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YPR170CYPR170C 336 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 REF2YDR195W 1602 nt2.15□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 CLN3YAL040C 1743 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SCP160YJL080C 3669 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 GPI19YDR437W 423 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 GLC7YER133W 939 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SDL1YIL167W 633 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YLR224WYLR224W 1110 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SDC25YLL016W 3147 nt2.14□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 LEU3YLR451W 2661 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 snR59snR59 78 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YHR054CYHR054C 1065 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 PSY1YKL076C 384 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 RNP1YLL046C 750 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 RPL36AYMR194W 303 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YNL046WYNL046W 519 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YOL029CYOL029C 606 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 DGK1YOR311C 873 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 CSM4YPL200W 471 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 HOS4YIL112W 3252 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SNF12YNR023W 1701 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SHE4YOR035C 2370 nt2.13□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SLN1YIL147C 3663 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 SEC16YPL085W 6588 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 VPS74YDR372C 1038 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 TIM9YEL020W-A 264 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YGR050CYGR050C 357 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 PRP21YJL203W 843 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 VPH2YKL119C 648 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YMR144WYMR144W 1029 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YMR254CYMR254C 309 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YOR152CYOR152C 771 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 KSP1YHR082C 3090 nt2.12□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 snR9snR9 187 nt2.11□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 RPL27BYDR471W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.11□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 YJL202CYJL202C 348 nt2.11□□□□□ -2.07
RPN6Q12377 ACF4YJR083C 930 nt2.11□□□□□ -2.07
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