Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPSF1Q10570 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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