Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms