Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELBQ01201 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELBQ01201 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELBQ01201 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELBQ01201 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELBQ01201 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELBQ01201 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELBQ01201 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms