Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTBN1Q01082 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms