Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIM1P81133 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms