Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOSBP53539 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOSBP53539 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOSBP53539 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOSBP53539 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOSBP53539 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms