Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF6P49848 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF6P49848 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF6P49848 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms