Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX1P48742 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX1P48742 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX1P48742 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX1P48742 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX1P48742 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX1P48742 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms