Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRATP43155 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRATP43155 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRATP43155 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRATP43155 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRATP43155 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRATP43155 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms