Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSG1P42857 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSG1P42857 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSG1P42857 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSG1P42857 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSG1P42857 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms