Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MLH1P40692 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH1P40692 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH1P40692 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH1P40692 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH1P40692 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms