Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL1P40616 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL1P40616 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL1P40616 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ARL1P40616 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms