Protein–RNA interactions for Protein: P40463

VHS2, Protein VHS2, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS2P40463 ORC1YML065W 2745 nt2.3□□□□□ -2.04
VHS2P40463 INP53YOR109W 3324 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 KRE33YNL132W 3171 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 MRD1YPR112C 2664 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 ROY1YMR258C 1662 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 snR84snR84 550 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 TWF1YGR080W 999 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 IGO1YNL157W 507 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YPL080CYPL080C 327 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 ASG1YIL130W 2895 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YDR239CYDR239C 2364 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 MDM1YML104C 3384 nt2.29□□□□□ -2.04
VHS2P40463 PMR1YGL167C 2853 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YDL016CYDL016C 303 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YGR293CYGR293C 462 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 SPO13YHR014W 876 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 IST3YIR005W 447 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 VPS51YKR020W 495 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 RLP24YLR009W 600 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 AFB1YLR040C 675 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YHC1YLR298C 696 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 MEI5YPL121C 669 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YPR172WYPR172W 603 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 RGC1YPR115W 3252 nt2.28□□□□□ -2.04
VHS2P40463 YDR090CYDR090C 933 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 SDC1YDR469W 528 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 LAG1YHL003C 1236 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YIL058WYIL058W 285 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 HYR1YIR037W 492 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YBR071WYBR071W 636 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YIL169CYIL169C 2988 nt2.27□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YJL070CYJL070C 2667 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 AYT1YLL063C 1425 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 CBF2YGR140W 2871 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YDR209CYDR209C 414 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 MPP6YNR024W 561 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 RCN2YOR220W 798 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YBR277CYBR277C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 TFC4YGR047C 3078 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YEL043WYEL043W 2871 nt2.26□□□□□ -2.05
VHS2P40463 ATG13YPR185W 2217 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 IRC4YDR540C 540 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 PEP8YJL053W 1140 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 ILM1YJR118C 612 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 RAM2YKL019W 951 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 BER1YLR412W 825 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YPL039WYPL039W 951 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 CYR1YJL005W 6081 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 GIS1YDR096W 2685 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 RGL1YPL066W 1440 nt2.25□□□□□ -2.05
VHS2P40463 POL3YDL102W 3294 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 DPB11YJL090C 2295 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 HNT1YDL125C 477 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 PRM8YGL053W 714 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 STE18YJR086W 333 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YJR141WYJR141W 1044 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 RPL19BYBL027W 570 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 UBX4YMR067C 1251 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 TOA1YOR194C 861 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YOR296WYOR296W 3870 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 NUP100YKL068W 2880 nt2.24□□□□□ -2.05
VHS2P40463 NMD2YHR077C 3270 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 INP52YNL106C 3552 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 SPR3YGR059W 1539 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 SGM1YJR134C 2124 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YLR278CYLR278C 4026 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 AHC2YCR082W 387 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YHL005CYHL005C 393 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 TPM2YIL138C 486 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 PET191YJR034W 327 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YLR297WYLR297W 390 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 RPL6AYML073C 531 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 MGR1YCL044C 1254 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 CDC20YGL116W 1833 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 TRS130YMR218C 3309 nt2.23□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YER138CYER138C 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YER160CYER160C 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YJR027WYJR027W 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YML039WYML039W 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YML045WYML045W 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YMR050CYMR050C 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.22□□□□□ -2.05
VHS2P40463 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.9 ms