Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	STH1	YIL126W	4080 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YJL119C	YJL119C	324 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YKL165C-A	YKL165C-A	234 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	RPL19B	YBL027W	570 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.77	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
NAB3	P38996	TAZ1	YPR140W	1146 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	RRP12	YPL012W	3687 nt		2.77	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	CLN3	YAL040C	1743 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	TOF1	YNL273W	3717 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	RRP6	YOR001W	2202 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YFR056C	YFR056C	369 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YJL147C	YJL147C	1149 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YJR023C	YJR023C	402 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YNL050C	YNL050C	813 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	GIP3	YPL137C	3831 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	MSL5	YLR116W	1431 nt		2.76	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	SSF1	YHR066W	1362 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YDR193W	YDR193W	399 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YHR180W-A	YHR180W-A	183 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	HYR1	YIR037W	492 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YLR302C	YLR302C	363 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YLR379W	YLR379W	375 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	ATX2	YOR079C	942 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.75	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	POL3	YDL102W	3294 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	FMP16	YDR070C	282 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	SRP21	YKL122C	504 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	ERG29	YMR134W	714 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YOR364W	YOR364W	369 nt		2.74	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	UBP11	YKR098C	2154 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YDL009C	YDL009C	324 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	GIM3	YNL153C	390 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	NDD1	YOR372C	1665 nt		2.73	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	MET18	YIL128W	3099 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YPL150W	YPL150W	2706 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	GPM2	YDL021W	936 nt		2.72	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
NAB3	P38996	NCB2	YDR397C	441 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	YHL005C	YHL005C	393 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	RAM2	YKL019W	951 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	LSM2	YBL026W	288 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	ALG14	YBR070C	714 nt		2.72	□□□□□ -1.97
NAB3	P38996	TRS20	YBR254C	528 nt		2.72	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
NAB3	P38996	REV1	YOR346W	2958 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	snR5	snR5	204 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RPL29	YFR032C-A	180 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	URA5	YML106W	681 nt		2.71	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
NAB3	P38996	DAD3	YBR233W-A	285 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	USO1	YDL058W	5373 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	TOR2	YKL203C	7425 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	IST2	YBR086C	2841 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	PTC5	YOR090C	1719 nt		2.71	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	GAL80	YML051W	1308 nt		2.7	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
NAB3	P38996	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YGR226C	YGR226C	210 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YHR054C	YHR054C	1065 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YIL058W	YIL058W	285 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YLR458W	YLR458W	381 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YJL070C	YJL070C	2667 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	NAN1	YPL126W	2691 nt		2.7	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YCR081C-A	YCR081C-A	237 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	AAD16	YFL057C	459 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RAD6	YGL058W	519 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	IST3	YIR005W	447 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	ECM9	YKR004C	1134 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	HRI1	YLR301W	735 nt		2.69	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YOR296W	YOR296W	3870 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	SIR4	YDR227W	4077 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RPL40A	YIL148W	387 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	ATG38	YLR211C	681 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	NBP1	YLR457C	960 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	ATP18	YML081C-A	180 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	JID1	YPR061C	906 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	MGR1	YCL044C	1254 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.68	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	YFL012W	YFL012W	447 nt		2.67	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	DFG10	YIL049W	762 nt		2.67	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RTT107	YHR154W	3213 nt		2.67	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RGA1	YOR127W	3024 nt		2.67	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	UBR2	YLR024C	5619 nt		2.67	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RUD3	YOR216C	1455 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	AHC2	YCR082W	387 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	PPH3	YDR075W	927 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RIM9	YMR063W	720 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	LSM7	YNL147W	348 nt		2.66	□□□□□ -1.98
NAB3	P38996	RPS12	YOR369C	432 nt		2.66	□□□□□ -1.98

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