Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms