Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPB2P35606 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPB2P35606 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPB2P35606 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPB2P35606 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms