Protein–RNA interactions for Protein: P32829

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRE11P32829 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 TIF35YDR429C 825 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 ERV1YGR029W 570 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YLR302CYLR302C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YML037CYML037C 1023 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YNR021WYNR021W 1215 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 TCB2YNL087W 3537 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 TRA1YHR099W 11235 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.67□□□□□ -1.98
MRE11P32829 PRM8YGL053W 714 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 OTU2YHL013C 924 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 RPS29AYLR388W 171 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 HHT2YNL031C 411 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 RIO2YNL207W 1278 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 TRS20YBR254C 528 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 GIN4YDR507C 3429 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 FAR11YNL127W 2862 nt2.66□□□□□ -1.98
MRE11P32829 KRE33YNL132W 3171 nt2.65□□□□□ -1.98
MRE11P32829 YLR001CYLR001C 2589 nt2.65□□□□□ -1.98
MRE11P32829 SPR3YGR059W 1539 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 BET4YJL031C 984 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 AFB1YLR040C 675 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YLR202CYLR202C 327 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YEF3YLR249W 3135 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 PUF4YGL014W 2667 nt2.65□□□□□ -1.99
MRE11P32829 BI4Q0120 1917 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 PSK2YOL045W 3306 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YHR078WYHR078W 1659 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 RPS17BYDR447C 411 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YGL015CYGL015C 393 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 BER1YLR412W 825 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SIN3YOL004W 4611 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 DNL4YOR005C 2835 nt2.64□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SWR1YDR334W 4545 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YPL150WYPL150W 2706 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SUL1YBR294W 2580 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 UBP16YPL072W 1500 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GDI1YER136W 1356 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 FIR1YER032W 2631 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GCV2YMR189W 3105 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 MET32YDR253C 576 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 CIC1YHR052W 1131 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 FYV4YHR059W 393 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 IST3YIR005W 447 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YNL046WYNL046W 519 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 KTI11YBL071W-A 249 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ALG14YBR070C 714 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YKR078WYKR078W 1758 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ARP8YOR141C 2646 nt2.63□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SSF2YDR312W 1362 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YBT1YLL048C 4986 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ADK1YDR226W 669 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YER189WYER189W 369 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SPO13YHR014W 876 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 EAF6YJR082C 342 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ARR2YPR200C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 TOR1YJR066W 7413 nt2.62□□□□□ -1.99
MRE11P32829 NPR3YHL023C 3441 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GPI17YDR434W 1605 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 HNT1YDL125C 477 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 MTC7YEL033W 420 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 LSM2YBL026W 288 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SWM2YNR004W 441 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ATP3YBR039W 936 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 NSL1YPL233W 651 nt2.61□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YIL166CYIL166C 1629 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GCD10YNL062C 1437 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 AHC2YCR082W 387 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 snR76snR76 109 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YDR090CYDR090C 933 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 RAD6YGL058W 519 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 NOP19YGR251W 591 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YGR290WYGR290W 444 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ARV1YLR242C 966 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 RPS1AYLR441C 768 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 PHO80YOL001W 882 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YOL134CYOL134C 390 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 ISU1YPL135W 498 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 HAA1YPR008W 2085 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 DBP10YDL031W 2988 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 PHR1YOR386W 1698 nt2.6□□□□□ -1.99
MRE11P32829 SPF1YEL031W 3648 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GPI19YDR437W 423 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 GLC7YER133W 939 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 RPL29YFR032C-A 180 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YKL066WYKL066W 444 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 RPL19BYBL027W 570 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 FPR1YNL135C 345 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.59□□□□□ -1.99
MRE11P32829 MLH1YMR167W 2310 nt2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.3 ms