Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H1P32780 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms