Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPS1P31327 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPS1P31327 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPS1P31327 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CPS1P31327 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CPS1P31327 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms