Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms