Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCAP28676 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCAP28676 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GCAP28676 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCAP28676 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCAP28676 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCAP28676 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms