Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRB3P28472 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms