Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms