Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms