Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms